Bazı jeotermal kaynaklardan termofilik bakterilerin izolasyonu ve endüstriyel öneme sahip enzimlerin belirlenmesi


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Süleyman Demirel Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Gıda Mühendisliği Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2012

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Hatice Akdaş

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Aynur Gül KARAHAN ÇAKMAKÇI

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada, Afyonkarahisar, Denizli, Kütahya ve Manisa illerindeki bazı jeotermal kaynaklardan alınan sıcak su örneklerinden 311 adet termofilik bakteri izole edilmiştir. Suşlar öncelikle katı besiyerinde proteaz, amilaz, lipaz, selülaz, ksilanaz ve pektinaz enzimlerini üretme yetenekleri yönünden nitel olarak incelenmiştir.Suşlardan proteaz, amilaz ve lipaz aktiviteleri en yüksek olan üçer suş ile bu enzimleri üretmeyen birer suş olmak üzere toplam 24 suşun 16S rRNA dizi analizi ile moleküler tanısı yapılmıştır. Bu suşlardan 9'u Geobacillus sp., 3'ü Geobacillus kaustophilus, 2'si Geobacillus thermoleovorans, 1'i Geobacillus lituanicus, 1'i Geobacillus stearothermophilus, 4'ü Bacillus licheniformis, 1'i Thermus sp., 1'i Thermus thermophilus, 1'i Anoxybacillus flavithermus ve 1'i Pseudoxanthomonas taiwanensis olarak cins ve tür düzeyinde tanımlanmıştır.Moleküler tanısı yapılan 24 suştan proteaz, amilaz ve lipaz enzimlerini üreten 18 suşun enzim aktiviteleri spektrofotometrik yöntemle nicel olarak da belirlenmiştir. Bu suşlardan en yüksek proteaz (D7-4 ve AT13-3), amilaz (M9-4 ve DT3-3) ve lipaz (D17-4 ve KT5-5) aktivitesine sahip suşlar seçilerek enzimleri saflaştırılmıştır. Saflaştırılan bu enzimlerin FTIR analizleri yapılarak ılımlı termofil ve ekstrem termofil bakterilerin enzimleri arasındaki farklılık belirlenmeye çalışılmıştır. FTIR sonuçları ile saflaştırılan enzimlerin ikincil yapıları hakkında fikir sahibi olunabilmiştir.En yüksek proteaz aktivitesine sahip olan 2 suş (D7-4 ve AT13-3) ile enzim üretmeyen 2 suşun (KT7-3 ve K2-1) morfolojik farklılıklarını belirlemek için TEM fotoğrafları çekilmiştir. Fotoğraflarda tüm suşların kendine özgü yapıları içerdiği, enzim üretimiyle ilişkili belirgin bir farklılığın olmadığı belirlenmiştir.